自作パソコン¥WINDOWS¥SYSTEM32¥CONFIG¥SYSTEMの不存在

ファイルが多すぎるので、削除したら次回立ち上げ時に、

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次のファイルが存在しないかまたは壊れているため、Windows を起動できませんでした: \WINDOWS\SYSTEM32\CONFIG\SYSTEM
オリジナル セットアップ CD-ROM から Windows セットアップ
を起動して、このファイルを修復できます。

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とメッセージが出て立ち上がらなくなったとのことです。検査用のxpにハードディスクをセットし、データ復元ツールを使って、System Volume Informationのファイルを読み取ります。
System Volume Information\restore{XXXXXX}\rpXXから新しいsnapshotフォルダを探し出し、その中の
_REGISTRY_MACHINE_SECURITY →  security
_REGISTRY_MACHINE_SYSTEM  →  system
_REGISTRY_MACHINE_SAM → sam
_REGISTRY_MACHINE_SOFTWARE →  software
_REGISTRY_USER_.DEFAULT → default
をそれぞれリネームして、
WINDOWS/system32/config/
に書き戻して、終了。
むやみにゴミ箱に捨てるのはやめましょう。
ccleanerやecleanerなどのアプリを使用し、不要ファイルのみを捨てるようにしましょうね。